Az eukarióta sejt kialakulása volt (maga az élet megjelenése után) a második legfontosabb evolúciós esemény. A fő és alapvető különbség az eukarióták és a prokarióta szervezetek között a fejlettebb genomrendszer jelenléte. A sejtmag megjelenésének és fejlődésének köszönhetően az egysejtű szervezetek alkalmazkodóképessége a rendszeresen változó létfeltételekhez, valamint a gyors alkalmazkodás képessége anélkül, hogy jelentős örökletes változásokat vezetne be a génrendszerben, meredeken megnőtt.
Az eukarióta sejt, amelynek citoplazmája az aktív anyagcsere-folyamatok területe, sikeresen leválasztva a genetikai információ tárolásának, leolvasásának és többszörözésének zónájától, képesnek bizonyult további biológiai evolúcióra. Ez a korszakos és végzetes evolúciós esemény a tudósok szerint legkésőbb 2,6 milliárd évvel ezelőtt következett be két geológiai mérföldkő – az archei és a proterozoikum – találkozásánál.
A biológiai struktúrák alkalmazkodóképességének és stabilitásának növekedése nélkülözhetetlen feltétele a teljes értékű biológiai evolúciónak. Az eukarióta sejt éppen nagy alkalmazkodási képessége révén tudott összetett szerkezeti felépítésű többsejtű élőlényekké fejlődni. Valójában a többsejtű biológiai rendszerekben az azonos genommal rendelkező sejtek a változó körülményekhez alkalmazkodva teljesen eltérő szöveteket képeznek, mind morfológiai tulajdonságaikban, mind funkcionalitásukban. Ez az eukarióták nagy evolúciós győzelme, amely az életformák ilyen grandiózus változatosságának megjelenéséhez vezetett a bolygón, és magának az embernek az evolúciós színterére.
Az eukarióta típusú sejtek szerkezetének számos olyan jellegzetessége van, amelyek nem jellemzőek a prokariótákra. Az eukarióta sejt nagy mennyiségben (90%) tartalmaz genetikai anyagot, amely kromoszómális struktúrákban koncentrálódik, ami biztosítja azok differenciálódását, specializálódását. Bármely eukarióta sejtet külön mag jelenléte jellemez. Ez a sejttípus fő megkülönböztető jellemzője. Egy másik fontos különbség a prokariótákhoz képest az eukarióta sejtek organellumái – állandó és változatos intracelluláris struktúrák.
Az eukarióta sejt a prokarióta sejtekhez képest összetettebb, többlépcsős érzékelési rendszerrel rendelkezik a különféle anyagokra vonatkozóan. A természetben nincs tipikus eukarióta típusú univerzális sejt. Mindegyikükhihetetlen sokszínűség jellemzi, ami éppen az evolúciós alkalmazkodási igénynek köszönhető. Az eukarióták nagyon fontos jellemzője az inherens kompartmentalizációjuk - az összes biokémiai folyamat lokalizációja különálló sejtkompartmentekben, amelyeket intracelluláris membrán választ el. Az eukariótáknak számos összetett szerkezeti összetevője van. Ilyen például a membránrendszer; citoplazmatikus mátrix, amely a fő intracelluláris anyag; a sejtszervecskék az eukarióták fő funkcionális összetevői.