A biológiában egy adott organizmus leírására, amely az állatok, gombák vagy növények birodalmába tartozik, saját nómenklatúrát dolgoztak ki. Egy fajhoz való tartozást tükrözi, a morfológia és a megjelenés jellemzőitől függően. Az állatok esetében a fajra való hivatkozás kritériumait alkalmazzák, attól függően, hogy a megtermékenyítés során milyen képességgel hoznak létre termékeny utódokat. Ezek a minták azonban csak ezekre a szervezetekre vonatkoznak, míg a mikrobákat nem lehet ilyen módon osztályozni.
A törzs fogalma a mikrobiológiában
A morfológiai tulajdonságokkal, de eltérő biokémiai és immunológiai jellemzőkkel rendelkező organizmusok nagyszámú jelenléte miatt lehetetlen szabványos nómenklatúra alkalmazása az elnevezéseknél. Ennek eredményeként olyan fogalmat vezettek be, mint a törzs. Ez a mikrobák tiszta kultúrája, amelyet egy bizonyos helyen egy bizonyos órában izoláltak és izoláltak.
Az egyik törzshez tartozó mikroba biokémiai, morfológiai, immunológiai és genetikai kritériumok tekintetében hasonló egy másik ilyen képviselőhöz. De ugyanazon a baktériumfajon belül ilyen analógia nem figyelhető meg. Ezért a törzs rugalmasabb elnevezése a mikrobatenyészetnek. Mert gyorsana genetikai anyag kicserélődése (mutáció) új, de eltérő tulajdonságú élőlények megjelenéséhez vezet egy fajon belül, ez a meghatározás az, ami lehetővé teszi a patogenitási és virulenciafaktorok pontosabb jellemzését.
Baktériumtörzsek
A baktériumok meglévő nómenklatúrája lehetővé teszi az élőlények típusainak osztályozását, de nem jellemzi új tulajdonságaikat. Ez utóbbiak gyors mutáció eredményeként jelennek meg, új tulajdonságokat szerezve, beleértve az emberre, haszonállatokra és növényekre, valamint más mikrobákra is kórokozókat. Az Escherichia coli példáján a nómenklatúra a következőképpen néz ki: királyság - baktériumok, típus - Proteobaktériumok, gamma-proteobaktériumok osztálya, rend - Enterobacteriales, Enterobaktériumok családja. A nemzetség az Escherichia, a faj az Escherichia colli. Az Escherichia colli fajba tartozó baktériumoknak azonban számos kultúrája létezik, amelyek eltérő tulajdonságokkal rendelkeznek. Külön baktériumtörzsekre izolálják őket, és további nevük is van. Például Escherichia colli O157:H7.
Az
E. coli maga is jelen van az emberi bélben, és nem okoz betegséget, de az O157:H7 törzs kizárólag patogén a nagyszámú virulenciafaktor jelenléte miatt. Az elmúlt 5 évben enterotoxigén betegségek járványát élte át.
Vírustörzsek
A törzs fogalma rugalmas elnevezése az olyan szervezeteknek, amelyek ugyanazokkal a tulajdonságokkal rendelkeznek, amelyeket izoláltak, majd azonosítottak és leírtak egy adott területen egy bizonyos időpontban. Lefutásával a vírus új tulajdonságokra tehet szert az antigén miattsodródás. Ezzel egy új vírustörzs jön létre, amely valószínűleg patogénebb, mint a szülője.
Az influenzavírus példáján világosan bemutathatja az új törzsek megjelenését. Az Orthomyxovírusok családjába tartozik, és az antigének (hemagglutinin és neuraminidáz) alapján nevezik el HxNy. X és Y számértékek, amelyek az antigének jelenlétét tükrözik. Példa erre a H5N1, amely a közelmúltban kirobbant sertésinfluenza-járványról ismert, amely gyorsan progresszív vérzéses tüdőgyulladással jár. Az elmélet szerint ebből a törzsből ugyanazon antigénsodródás miatt egy új és veszélyesebb törzs fejlődhet ki.
Gombatörzsek és protista törzsek
A penészgombák a legkevésbé változékonyak az összes mikroba közül, bár biokémiájuk is összetett. A baktériumoknál és vírusoknál bonyolultabb szerkezet, valamint a gyors géntranszfer mechanizmusainak hiánya miatt az új gombatörzsek száma enyhén megnő. Van egy olyan vélemény is, hogy minden újonnan felfedezett gombatörzs egy már létező organizmus, amely egyszerűen nem jött be a kutatók számára.
Hasonló helyzet van a protisták birodalmában is. Alacsony a mutációs képességük, így rendkívül kicsi annak a valószínűsége, hogy új törzsek gyorsan megjelennek. Az azonos fajhoz tartozó organizmusok új változatai azonban továbbra is megjelennek. Ezért láthatóan korábban is léteztek, de nem fedezték fel.
